其次要賦予大學充分的辦學自主權。大學的管理部門過多并不能簡單地看作是大學的懶政，各種檢查過濫、承擔的職能過多，也直接導致大學的日趨膨脹。因此，大學不僅需要去行政化改革，也需要從繁重的檢查、過多的職能當中解放出來。這就要求，教育主管部門逐步將權力真正下放到大學手中，讓大學擁有更多的辦學自主權。不改變管理上的“一刀切”現狀，大學“千人一面、千篇一律”的問題將永難改變。

“獨立之思想、自由之精神”，這是“五四運動”留給我們的寶貴思想遺產。溫家寶總理所言“獨立的思考、自由的表達”是對這一遺產的再次強調。中國高等教育需要改革的地方還有很多，歸根結底，是要讓大學擁有思想的自由、學術的自由、辦學的自由。唯此，大學才能找到丟失的靈魂，中國才可能出現世界一流大學。