福建主體功能區規劃要與海西建設有機結合起來，這需要把握二者之間的關系，從而使得主體功能區的形成轉變為促進福建區域發展的強有力工具，為福建發展服務。要編制省級主體功能區規劃，形成福建省主體功能區，這實質上可以視為以海峽西岸經濟區為核心概念的福建區域發展戰略的具體化。

    基于上述認識，可以在福建主體功能區規劃工作中，找到與這一區域發展戰略的結合點，并依此提出一個總體構想，其基本框架包括下列幾點：

    一是按照中央有關文件精神和具體指導意見，首先在福建轄區國土上確定限制開發區域和禁止開發區域。中央有關文件規定：限制開發區域是指那些資源環境承載能力較弱，大規模積聚經濟和人口的條件不夠好，并且關系到國家或較大區域范圍生態安全的區域；禁止開發區域則是指依法設立的各類自然保護區。中央有關文件給出的指導意見是：以農業為主的地區，原則上要確定為限制開發區域；礦產資源豐富但生態環境承載能力較弱的區域，原則上也應確定為限制開發區域；依法設立的省級各類自然文化保護區域，要確定為禁止開發區域。

    根據上述規定和具體指導意見，我們并不難在福建轄區國土上確定限制開發區域和禁止開發區域的數量、位置和范圍。由于我省原先已經確定了各類自然和文化保護區域，可供直接參照。由此看來，這次規劃編制工作的重點，應在于確定限制開發區域的數量、位置和范圍，具體來說要做到以下幾點：那些典型的礦產區和農業區，可以依照中央有關文件的規定，直接確定為限制開發區域；那些并不是那么典型的礦產區和農業區，可以根據是否具備大規模的工業化和城市化潛能，來確定是否列入限制開發區域；某些礦產區和農業區確實具有一定的工業化和城市化潛能，但又會給周邊地區帶來嚴重的資源環境問題，應該列為限制開發區域。

    二是在確定了限制開發區域和禁止開發區域的數量、位置和范圍的基礎之上，可以進一步確定福建轄區國土上的另外兩類區域，即優化開發區域和重點開發區域。在這點上，可以直接與以海峽西岸經濟區為核心概念的福建區域發展戰略有機結合起來。我省沿海三個中心城市（福州、泉州、廈門）可以確定為優化開發區域，而與這三個中心城市相毗連的內陸腹地，則確定為重點開發區域。

    三是依照中央有關文件的規定，確定省際邊界地帶的主體功能區。國務院文件規定，位于省級行政區邊界、均質性較強的區域，應確定為同一類型的主體功能區。依此，與我省交界的省際國土有三處，即與北邊的浙江省交界、與南邊的廣東省交界、與西邊的江西省交界。按照以海峽西岸經濟區為核心概念的福建區域發展戰略，這些交界其實都屬于海峽西岸經濟區的范圍之內。

    就省際交界地帶而言，在這次主體功能區規劃編制工作中，應把握的一個原則是：以我為主、省際協作。就是以福建區域發展戰略為主，依照中央文件精神，同時，要適當地與相鄰的兄弟省份協作，以確定交界區域的類型、數量和具體范圍。

    四是在確定我省內陸國土的主體功能區的基礎之上，將海洋主體功能區考慮進來，并使得這兩種功能區規劃相互銜接。在海洋主體功能區規劃編制工作中，應遵循兩個原則：其一，我省海洋主體功能區規劃要與我省陸地國土主體功能區規劃有機結合起來；其二，我省海洋主體功能區規劃要與以海峽西岸經濟區為核心概念的福建區域發展戰略有機結合起來。

　　海洋主體功能區規劃的主要內容，重點應包括港口、航道和海洋專屬功能區這幾項，具體來說是：

　　第一，在福建所轄海區中，首先將重要港口列入所在城市的主體功能區，并依所在城市的主體功能區類型，來確定那些港口的主體功能類型；

　　第二，由多個港口組成的港區，比如環廈門灣港區，應該被視為一個整體，來確定其主體功能的類型，并與陸地區域的主體功能相銜接。如果港區分屬于兩個或兩個以上的行政轄區（比如環廈門灣港區屬于廈門和漳州兩個行政轄區），那么，要打破行政區劃限制，依照主體功能區規劃的原則來對待。

　　第三，航道所在的海區，原則上要附屬于港口，在主體功能定位上應列為同一種類型。

　　第四，海洋專屬功能區，包括專屬經濟區和特殊功能區，前者應依據專屬經濟區的性質而確定其主體功能，后者原則上可以被列入禁止開發區域，與陸地上的自然和文化保護區相銜接。