我們大力提倡雙百方針就是為了保護新的觀點、新的學派、新的學術，從而使哲學社會科學事業不斷發展。但是我們所說的雙百方針不是要違背“二為”方向。哲學社會工作者在敢于發表不同意見的同時，要有強烈的社會責任感，要努力成為人民靈魂工程師，維護社會大團結，維護社會主義制度，維護中國共產黨的領導。

第三個關系是理論研究與深入實踐的關系。當今國際國內的新情況、新問題層出不窮，時代在召喚我們，研究解決時代具有戰略性、前瞻性的重大問題，深入貫徹落實社會主義事業。大力加強國際金融危機的研究，深入研究如何認識危機的根源和發展的可能趨勢，為黨和政府建言獻策。比如說認真貫徹《決定》有效的擴大黨內民主，有效的抑制腐敗現象。

第四個關系是基礎理論應用理論與應用對策研究的關系。基礎理論研究是指研究者根據人民在實踐中獲得的對客觀事物的認識，按照一定的邏輯對之進行必要的整理，將之條理化、系統化為一定的概念和原理體系，為基礎理論研究收集、整理、甄別史料和資料也應屬于基礎研究的組成部分。一般來說，哲學和人文學科都屬于基礎研究。二是應用理論研究，應用理論是指事物的一般規律在不同的學科的規律性的反映與體現。可以說，應用理論研究是應用對策研究的指導方針，同時又是應用對策研究的理論升華。一般來說，社會科學各學科都有一個應用理論研究問題。三是應用對策研究，這是各個學科尤其社會科學各學科對國際國內出現的新形勢、新問題具體應對決策的對策建設。一般來說，應對對策研究、主要是社會科學各學科的任務，但人文各學科也往往在這方面承擔著重要的責任，應當正確處理技術理論研究、應用理論研究和應用對策研究三者之間的關系。

第五個關系是集體協作攻關和充分發揮個人的積極性的關系。哲學社會科學領域無限廣闊，一般地說，一些重大特別是跨學科的重大課題，任何單獨學科特別是個人是無法承擔完全的，必須有一定數量的不同學科的專家學者集體協作攻關。課題立項時，對基礎性研究、中長期前瞻預測性研究、應用對策性研究的重大課題，應按照輕重緩急，進行分門別類的統籌規劃、統一使用科研力量，以免一些容易出成果、出經濟效益的熱點問題重復立項、重復研究，浪費人力、物力、財力，而一些周期較長、不易直接出經濟效益的但具有很大的社會效益的難點問題，以及事關全局的中長期前瞻預測性和基礎性研究，卻無人問津或投入不夠。