不過，“3·11”日本東北部大地震分散了普天間機場轉移糾紛的焦點，駐日美軍積極投入日本救災和搜索失蹤者的“朋友作戰”等行動也得到日本輿論普遍好感，使得沖繩的立場目前在日本顯得有些“曲高和寡”。

13日到訪那霸市沖繩縣府的北澤說，日本政府經再三探討，還是敲定V字形建設方案，雖然無法在2014年完成建設計劃，但期待盡快實現，并希望在二加二會議上形成文件。

對此仲井回答說，就算日美政府決定了，只要沖繩縣民和當地居民不同意，事實上還是不能推進。他說，沖繩強烈要求普天間機場縣外轉移，非常遺憾日本政府這一決策。

北澤與仲井會談時，縣府外有近百名宜野灣市民抗議靜坐，他們手持的標語雖是反對美軍在普天間機場配備新型運輸機，但也反映了普天間機場周邊居民存在對轉移案可能夭折的疑慮。